Já se passou quase um ano desde que os alienígenas atacaram dando início a uma nova realidade e a um mundo totalmente diferente. A Segunda Temporada de Falling Skies acompanha o Segundo Batalhão de Massachusetts em sua jornada rumo a Charleston, na Carolina do Sul, na tentativa de encontrar mais sobreviventes e combatentes contra os contínuos ataques alienígenas. Tom Mason tenta conduzir a resistência e sua família, enquanto novos perigos e antigos inimigos parecem desviá-los do caminho a cada momento.